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从理解疾病到药物发现，科技巨头们押注的「虚拟细胞」究竟是什么？
过去一年，「虚拟细胞」（Virtual Cell）成为了生命科学和 AI 交汇处最热门的词汇。全世界的科研机构和科技巨头都纷纷押注，共同推动着一场「虚拟细胞革命」。DeepMind CEO 诺奖得主 Demis Hassabis 在多次采访中说「虚拟细胞」将是 deepmind 重要的研究方向，他将致力于构建能够模拟整个细胞的AI系统。马克·扎克伯格与妻子普莉希拉·陈共同发起的科研机构 Chan Zuckerberg Initiative （CZI）也是在今年高调宣布，他们将要在未来十年在虚拟细胞上投入数亿美元，开发开放数据集与计算工具。就在上个月，NVIDIA 宣布了与 CZI 的合作，通过提供 AI 基础设施，共同推动虚拟细胞的开发和应用。我们今天的节目请到了上海交通大学医学院教授、万乘基因创始人施威扬老师。一起来聊一聊究竟什么是「虚拟细胞」？我们要如何将细胞数字化? 以及虚拟细胞将如何改变疾病治疗、药物研发，甚至我们理解生命的方式？【本期嘉宾】施威扬，上海交通大学医学院教授、万乘基因创始人【时间戳】00:35 从 DeepMind、CZI 到 NVIDIA，为什么科技巨头纷纷押注「虚拟细胞」？02:29 什么是虚拟细胞？它是一个试图模拟真实细胞行为的超级大模型06:46 生物学曾被视为「天书」，AI 如何解构这种极度复杂的高维系统？09:24 从「90%实验+10%计算」到「10%实验+90%计算」，AI 带来生物学研究的范式转移15:57 科技大厂追求通用基座模型，药企更务实于垂直专有模型，谁能跑赢？18:17 虚拟细胞进化史：从「规则模型」到「数据驱动」29:47｜如何构建虚拟细胞？统一表征 → 多组学数据 → 模型 → 实验验证（lab-in-the-loop）36:53 模型幻觉与黑箱：生物模型的可靠性和可解释性46:32 虚拟细胞的应用：药物发现、合成生物学、细胞与基因治疗（CGT）53:27 数据量的匮乏与维度的缺失——为什么我们需要千万级的多组学数据？01:09:12 「图谱计划」的争议：为什么大规模测序是 AI 时代的必要基础设施？📬【联系我们】商业合作：[email protected]微信：atgcdoctorschat，备注「加听友群」
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从 AlphaFold 到 RNA 靶点预测，AI 如何重塑新药研发的未来?
这是一期与《科技早知道》的串台节目2024 年的诺贝尔化学奖是颁给了三位在蛋白质结构预测和蛋白质设计领域作出开创性贡献的科学家。这标志着 AI 已经成为生命科学的核心工具，正在改变我们理解生命的方式和重塑药物研发的未来。我们今天的嘉宾是深圳湾实验室的周耀旗教授，他是这场变革的亲历者和推动者之一。他最初在学术界专注于蛋白质结构预测，后来他敏锐地意识到 RNA 领域的潜力与挑战，将研究方向转向 RNA 结构预测。现在他又走上创业之路，带领团队开发以 RNA 为靶点的小分子药物，探索如何将基础研究真正转化为新的疗法。今天的节目我们聊一聊作为蛋白质结构预测工具的 AlphaFold3，它的突破与局限在哪里？RNA为什么是新一代药物的重要靶点？以及 AI 在新药研发中的作用究竟是什么?【本期人物】周耀旗，深圳湾实验室资深研究员，砺博生物科学创始人【时间戳】02:42 为什么蛋白质结构如此重要？解析蛋白结构是理解生命机器的关键05:47 蛋白质结构预测简史：基于模板 --> 碎片拼接 --> 二面角+距离预测14:26 「1+2=3」：AlphaFold 革命性飞跃的背后17:40 结构生物学家会不会被替代？聊聊 AlphaFold 还做不了的事23:26 RNA 结构预测为何更难？仅4个碱基，结构不稳定，已知数据稀缺29:24 蛋白质只是「提线木偶」，RNA 才是「操纵者」31:56 从靶向蛋白到靶向 RNA -- HIV蛋白酶抑制剂的成功和 KRAS 蛋白的「光滑锁眼」的难题35:49 靶向 RNA 药物的里程碑：首个靶向 RNA 的小分子药利司扑兰（Risdiplam）38:50 在缺乏结构数据的情况下，如何开发靶向 RNA 的药物？43:06 AI 在新药研发中的真实作用：是加速器，而非革命45:39 AI for Science：摆脱数据依赖，回归物理，寻找分子世界的「牛顿定律」📬【联系我们】商业合作：[email protected]微信：atgcdoctorschat，备注「加听友群」
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48:07
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何时得诺奖？好似国足出线的年度话题又来了！
又到了一年一度的诺贝尔奖周，关于“中国科学家何时能获得诺贝尔奖”的讨论再次成为热点。中国如今在科研论文发表数量和引用量上已位居世界前列，但为何在摘取科学界最高桂冠方面似乎总差一步？本期节目，我们邀请到了两位学术界的嘉宾。我们将从诺奖谈起，对比中美科研制度，特别是 Tenure Track（预聘长聘制）在两国截然不同的实践逻辑。我们还将探讨一个难以量化却很重要的概念——科研品味，它如何影响原创性研究的诞生。【本期嘉宾】史冬波北京雁栖湖应用数学研究院研究员公众号：熊彼特的厨房李老师北京某高校助理教授🎤【时间轴】02:48 中国科研的矛盾现状：量化指标已达世界第一，但缺乏真正的原创性突破。08:23 美国如何成为现代科学中心:“Tenure Track” 人事制度和现代化的科研资助体系。14:42 中美Tenure Track制度差异：美国模式是“风险投资”，中国模式更像“内部赛马”式的筛选。23:12 现有制度筛掉了有“品味”的人才，并鼓励“短平快”的研究。33:23 难以量化的“科研品味”48:05 当下的评价体系让从事长线、冷门研究的风险与代价过高。52:09 中国擅长“标量型”创新（延伸），缺乏“矢量型”创新（开辟新方向）。57:21 如何激励原创？守住诚信底线、加强科学传播、鼓励社会资助📬【联系我们】商业合作：[email protected]微信：atgcdoctorschat，备注「加听友群」
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1:02:50
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三体人进攻地球，首先封锁我们哪些研究？聊聊2025诺贝尔医学奖
玛丽·布伦科（Mary Brunkow）、弗雷德·拉姆斯德尔（Fred Ramsdell）和坂口志文（Shimon Sakaguchi）因其在外周免疫耐受方面的基础发现而获得 2025 年诺贝尔生理学或医学奖。表彰他们关于外周免疫耐受（peripheral immune tolerance）的发现，尤其是调节性T细胞（Treg）的识别与功能阐明，以及FOXP3基因作为Treg谱系开关的确定，这一系列的工作让我们理解了：免疫系统不只是“打仗”，它也有“刹车”和“自我约束”的机制。我们今天的节目就来聊聊这次的诺奖🎤【时间轴】00:42 诺奖？我来评评！(‾◡◝)05:07 诺奖奖什么？「外周免疫耐受（peripheral immune tolerance）机制的分子基础」👀06:57 获奖者玛丽·E·布伦科、弗雷德·拉姆斯迪尔、坂口志文简介👏09:04 免疫系统调控科学史话11:29 被嘲笑的科学家：坂口志文与Treg细胞的发现14:56 曼哈顿计划也搞生物研究？FOXP3基因的发现20:45 同获诺奖“姊妹奖”，Alexander Rudensky 为何与诺奖擦肩？24:20 Treg 离“治病” 还有多远？27:10 工业界？学术界？国人的诺奖在哪里？📕【相关资料】诺奖官网-2025：www.nobelprize.org工作细胞：细胞大作战 www.bilibili.com📬【联系我们】商业合作：[email protected]微信：atgcdoctorschat，备注「加听友群」
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科研焦虑背后，我们遗失了什么？和豆丁老师聊聊「找到自己的那片羽毛」
暑假转瞬即逝，新学期马上就要开始了。无论是科研的重压还是就业的迷茫，我们常常会陷入抑郁、焦虑和自我怀疑的情绪困扰中。本期节目，我们邀请到了一位特别的嘉宾—豆丁老师—她在高校从事学生工作十余年，同时也是一位叙事治疗师。她将和我们分享，如何更好地认识自己、接纳自己。在这场对话中，我也经历了一次“小型心理咨询”。从一开始迫切地想寻求“为什么”和“怎么办”的标准答案，到后来在豆丁老师娓娓道来的讲述中，逐渐转向探索自己的内心。本期嘉宾豆丁老师 Top2 高校心理工作者，叙事教练（NC）发起人，中国心理学会临床心理学注册工作委员会注册心理师⏰ 时间轴：03:29 什么是“叙事治疗”？—— 你不是一个“抑郁的小兔子”，而是一只遇到了“抑郁”这个问题的小兔子06:46 为什么心理咨询师不直接给答案？—— 警惕“猜词游戏”式的对话12:37 从“一片羽毛”到“多片羽毛”：如何找到人生的多个支点？15:31 是什么在指引我们前行？—— 内心深处的“灯塔”21:39 学生心理问题的共性：被“单一标准”所裹挟25:54 解决问题的两种视角：自上而下 vs 自下而上29:38 学会“允许失败”：我们都需要增强一点“脆皮”耐力32:30 给研究生的一些实用建议：如何扩充你的情绪急救“工具箱”？38:23 人生的剧本，由我们自己书写读博故事征集：你在读博或者科研的过程中是否经历过一些至暗时刻呢？坑爹的课题？变态的导师？背刺你的实验室同伴？有没有一些经历让你在某个时刻想要放弃呢？点击链接告诉我你的科研故事联系我们商业合作：[email protected]微信：atgcdoctorschat，备注「加听友群」
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